湘南工科首战败北，主力重伤，替补少年必须在冬季选拔赛前完成觉醒。
第二季紧接第一季结尾。湘南工科在全国大赛首轮惨败于王者球队“博多商大附属”，队长兼王牌哀川和彦膝盖韧带断裂，面临赛季报销。二年级的替补控卫藤原拓磨被迫推上首发。他身高只有165cm，但拥有惊人的速度和传球视野。在教练的魔鬼训练下，藤原开发出了“零秒出手”的超高速三分投射。冬季选拔赛预选赛，湘南工科再次遭遇老对手，藤原用一场50分10助攻的表演带队复仇，闯入全国大赛。最终话，哀川奇迹复出，双后卫组合正式成型。
相比第一季，第二季更注重团队磨合与逆境成长。配角刻画丰满，藤原的蜕变线令人动容。比赛作画张数惊人，最后三分钟的攻防战足以载入运动番史册。
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